続MrBayes奮闘記

やはり計算は終わっていなかった…。
やっとこさ計算が終わったのは15時頃。logを見ると計算時間は107000秒＝約29時間！！
これだけ長くなったのは、予定では10,000世代の計算だけだったはずが、一気に1,000,000世代を計算していたからと判明。きちんと設定したはずなのになぁ。こりゃどこかミスったなぁ。
そもそもマルコフ連鎖モンテカルロ法とか計算の中身をぜんぜん理解しないまま走らせたのもまずかったので、一つ一つのコマンドが何を意味するか勉強する。
うーむ、しかし難しい…。

何回かいろいろいじってみると実行ファイルの定義記述とMCMCの記述を一つのファイルにまとめてあるのが問題なような気がしてきた。MCMCの記述が有効になってない感じ。いやMCMCの実行の仕方がまずいのかも。
ここらを明日また検証したい。

スライドの完成度65%。