2006-03-01から1ヶ月間の記事一覧

整理整頓

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HDDを圧迫していたpublicマイクロアレイデータ(主にCELファイル)をとりあえずspotfireに取り込んでアノテーションもつけて保存。はき出されるsfsファイルはもとのCELファイルの容量からは信じられないくらい圧縮されているので、取り込んだあとほとんど使…

某学会

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はたしてうまくいったかな。。吉報待つべし。

bioinformatics-jp

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なぜかいままで登録していなかったので^^;、遅ればせながら参加。

あっという間に

publicなマイクロアレイデータをいくつも落としてたら、気づくとHDDが満タン近くになっていた…。HDD換装も頭をよぎるが、換装作業はなかなか骨が折れそうなので、当面は手元に必要なものとそうでないものの選別・整理をしてやりくり。

サイボク経由ふるさとの湯行き

まきばの湯が臨時休業だったので、この変則コース。 ブタタンシチューに挑戦。これも美味。 2度目のふるさとの湯はちょっとリニューアルした感。

某◎エラー

◎のメーカーさんにいろいろ聞いてみたりしていたけれど、最終的に自力解決に至る。気づいてから考えてみれば、なんだそんなことか的な現象ではあったけれど、乗り越えねばならない壁はやっぱりそういうパターンがとても多いんだなと、ここでも実感。自己レス…

BioCompass

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バイオ情報検索ツールBioCompassをtheclaさんにデモしていただく。既報通り、遺伝子と関連文献の検索のところはInfo-Pubmedに似ているなぁという印象。その後に引き続くアノテーション情報の付加とかネットワーク描出はとても簡単にできそう。 しかし、この…

突貫工事

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実はもうすぐ目前に迫っていたという某学会用のスライドの見直しを急ピッチで進める。今回のは自分が参加しないことも手伝ってか、いささかのんびりしすぎてた感がある…^^;。 こういう土壇場になってくると、いくら通信技術が発達したとはいえ、遠隔であ…

腕立て 50×2セット 腹筋 同上 アレイ上げ(2方向) 各50回

三寒四温

とは昔の人はよく言ったもので、寒い日が続くことがだんだんなくなってきて、今日のような暖かな日が増えてくるといよいよ春なんでしょう。今日はこの暖かい陽気に誘われて、いよいよ完成してきた某キャンパスを散策してみた。人っ子一人いない広大なキャン…

起きたら

お昼過ぎ。。昨日は少し夜更かしをしすぎた…。

ちょっとしたぜいたく

「天然だし醤油」 毎日お世話になっている卵ご飯をさらにグレードアップさせる一品。普通の醤油とは違ってちょっと甘めなところが◎。

報告会

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2ヶ月に1度制になったので今回は聴衆。ということは来月は発表。この1ヶ月で自分のデータも具体的なものを出していかないと。。

失敗から学ぶ

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どうやら今回もそういうパターンだった模様。。まあこういう痛い目にあうパターンの方が次から同じミスをしなくなるのでいいのかもしれない。副産物として得るものもこっちの方が多い気がするし。 そして、データが大量になってきたときに手作業でえっちらお…

気づけば…

およそ一ヶ月ぶりに。 腕立て 50×2セット 腹筋 同上 アレイ上げ(2方向) 各50回

続Info-PubMed

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自分の興味ある遺伝子と関連のある遺伝子を調べて〜、まではできてたものの、その関連に言及してる論文へのリンクの場所がわからず悩ましい感じだったが、遠方からの天の声(!?)によって無事解決。ここではなんでもかんでもつかんで投げればいい、ようだ^…

応用問題

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っぽく、さらにこれまでの復習もかねて、NCBIのGEOから関係のありそうなマイクロアレイデータを落としてきて、ごにょごにょしてspotfireで可視化、の一連の流れをだーっとやってみる。…そしてまた壁にぶち当たる、と。。

ようやく

お腹もちゃんと減るようになって^^;、復調を実感。腹が減らないというのは今まで未体験な風邪の諸症状だったのでちょっと不安だったけど。。 と、ほっとしたのもつかの間。復調をあざ笑うかのような雨でびしょぬれに。。風邪が息を吹き返さないよう祈るの…

某事例集

締め切りは2月末日だったので一日遅れてしまったが、本日無事作成終了→提出。50MBを超えるデータの提出にfilebankのセンドファイルという無料サービスが活躍。これはなかなか便利。 今回の事例集作成は自分の勉強に直結する部分だったし、こういう作業も割と…