ひさびさにR
を使って、マイクロアレイデータのRMA補正した結果をcsvファイルに出力しようと
library("affy") data <- justRMA() exprs2excel(data,"expression.csv")
をしたら、
以下にエラー function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function "exprs2excel", for signature "function"
がでてしまってcsvファイルが作れず。
いろいろ探しても解決策が見つからなかったものの、write.exprs関数でタブ区切りテキストを出力できることを発見。
library("affy") write.exprs(justRMA(), file="expression.txt")
これでRMA補正したexpression.txtを出力できた。